Агенцията е създадена през далечната 1950 година като Управление за държавно снабдяване и държавен резерв.

В периода 1950-1956 година Управлението за държавно снабдяване и държавен резерв е имало собствена проектантска организация, което е позволило бързо да се проектира и изгради за сравнително кратки срокове единна мощна материално-техническа база към управлението. Тогава са изградени и пуснати в експлоатация първия етап на базите Пордим, Ясен, Дъбник, Ресен, самостоятелните складове в Павликени, Враца, Габрово и др., складовете за дървен материал в Карлово, Казанлък, Пещера, Разлог, много зърнено-фуражни бази, съдови вместимости за петролни продукти, растителни масла и други.

През годините Управление за държавно снабдяване и държавен резерв многократно е преобразувано до 2001 г., когато е утвърден Устройствения правилник за определяне устройството, дейността, организационната структура, съставът и организацията на работа на Държавната агенция „Държавен резерв и военновременни запаси“ при Министерския съвет.

През 2004 г. от териториалните звена на Агенцията отпада ТД ДР – Шумен. През периода 2016 - 2017 г. от структурата на ДА ДРВВЗ отпадат две териториални дирекции – Стара Загора и Враца.

Днес в структурата на ДА „Държавен резерв и военновременни запаси“ са включени централно управление, териториални дирекции в София, Бургас, Варна, Велико Търново, Пловдив, Плевен, както и Централна техническа база. Към териториалните дирекции функционират складови бази за съхранение на държавни резерви, военновременни запаси, запаси за извънредни ситуации и целеви запаси от нефт и нефтопродукти.